华大团队联合斯坦福医学院、武汉大学取得时空算法工具包最新突破，全面支撑发育、疾病等研究

IT之家 11 月 12 日消息，华大集团宣布，华大生命科学研究院联合斯坦福大学医学院、武汉大学电子信息学院等机构实现了时空算法工具包最新研究突破，相关研究成果已于 11 月 12 日发表在国际顶级学术期刊《细胞》上（IT之家附 DOI:10.1016/j.cell.2024.10.011）。

据介绍，该国际协作团队借鉴了物理学、地理学、经济学等多个跨学科领域的数学模型，开创性开发了三维时空建模工具包 Spateo，使空间转录组学技术能够精细地重构器官三维结构、系统地量化时空动态过程。

Spateo 工具包提供多种算法选择，具备三维重建、区域数字化、细胞间相互作用推断、“形态计量向量场”以及用于交互式操作的可视化界面等独特优势。

为验证其性能，研究团队以小鼠胚胎和果蝇发育的研究为例，探索了三维空间中随时间变化的器官生态形成机制，并构建了小鼠胚胎发育的“3D 分子全息图”，证实了 Spateo 将显著提高我们对发育过程中器官形成的理解。

文章第一作者、斯坦福医学院邱肖杰教授认为，Spateo 代表了我们在创建预测性虚拟胚胎模型的道路上的重要里程碑。与其它方法不同，Spateo 能够将生物系统视为一个相互连接的整体，而不仅仅是单个细胞，这在揭示先天性疾病背后的分子机制方面具有巨大的潜力，对促进人类健康具有深远的影响。

华大表示，Spateo 工具包是当前时空算法工具领域“天花板”级别的存在，将为生命科学的未来研究奠定重要基础。该工具包的发布标志着时空组学研究迎来革新性突破，可全面支撑胚胎发育、脑科学、疾病等领域研究，为实现高精度时空生命全景观研究迈出了极为关键的一步。

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