我国科学家研发高稳健蛋白质组分析系统,可诊断早期胃癌标志物

2023-12-23 10:29IT之家 - 故渊

IT之家 12 月 23 日消息,中国科学院大连化学物理研究所近日发布公告,宣布开发出一种位点特异性糖型的高稳健蛋白质组分析系统,可以诊断早期胃癌标志物。

该项目由该研究所生物技术研究部生物分离分析新材料与新技术研究组(1809 组)叶明亮研究员团队和空军军医大学聂勇战教授团队等合作开发,规模化分析 278 例临床样本进行 N-糖基化蛋白质组,筛选并验证了新型蛋白质糖基化类生物标志物,可用于诊断胃癌尤其是早期胃癌。

目前在临床上使用的肿瘤标志物基本上都是糖蛋白质。蛋白质糖基化的异常与疾病的发生发展密切相关,但是还没有在特定蛋白质、特定位点上的特定糖型(即位点特异性糖型)的疾病标志物。

研究人员开发出了一个高稳健的位点特异性糖型蛋白质组学分析系统。该系统采用自动化方法富集生物样本中的 N-完整糖肽,然后采用微流 LC-MS / MS 系统检测 N-完整糖肽,并利用团队开发的 Glyco-Decipher 软件鉴定和定量位点特异性糖型。

科研人员使用该系统分析了 200 多个样品,发现其富集特异性保持在 88.1% 到 91.7% 之间,展现了稳定的糖肽富集性能。

在 10 个批内 / 批间的质量控制样本中,N-完整糖肽、糖基化位点和糖蛋白的鉴定数目的相对标准偏差均低于 7%,并且定量 N-完整糖肽的 Pearson 相关系数平均值为 0.909。

经过长时间分析超过 200 份大队列样本后发现,每个质量控制样本依然能稳定地鉴定到平均 1900 条完整的 N-完整糖肽。

因此,该系统具有高灵敏、高稳健的 N-完整糖肽鉴定性能,为 N-糖基化位点特异性糖型的规模化分析提供了一个有力的分析工具。

IT之家附上论文参考地址如下:https://doi.org/10.1002/advs.202306955

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